A two-stage genome-wide association study to identify novel genetic loci associated with acute radiotherapy toxicity in nasopharyngeal carcinoma.

Release time:2023-01-31

Impact Factor:41.444

DOI number:10.1186/s12943-022-01631-8

Affiliation of Author(s):中南大学湘雅医院

Teaching and Research Group:临床药理研究所

Journal:MOLECULAR CANCER

Key Words:Nasopharyngeal carcinoma, GWAS, Radiogenomics, Radiotherapy toxicity, Skin reaction, Dysphagia, INHBB, STY8

Abstract:鼻咽癌（NPC）是一种起源于鼻咽部的上皮性恶性肿瘤。鼻咽癌的发病具有独特的地域分布格局，中国患者约占所有患者的50%。鼻咽癌的主要治疗方法包括放疗、化疗和免疫治疗。其中，放射治疗具有重要作用。与鼻咽癌 (NPC) 放疗的急性副作用相关的遗传变异在很大程度上仍然未知。本研究进行了两阶段全基因组关联分析，包括总共 1084 名患者。发现5个 SNP（rs6711678、rs4848597、rs4848598、rs2091255 和 rs584547）在验证后显示出统计学意义。在所有5个 SNP 的突变次要等位基因携带者中，放射治疗毒性更为严重。分层分析进一步表明 rs6711678、rs4848597、rs4848598 和 rs2091255 与 EBV 阳性、晚期（III 和 IV）同时接受同步放化疗和诱导/辅助化疗的患者的皮肤毒性相关，OR 值范围为 1.92 至 2.66 。对于 rs584547，在发现（P = 1.27 × 10−6，OR = 1.55）和验证（P = 0.002，OR = 4.20）队列中，发现 A 等位基因携带者吞咽困难的发生率很高。此外，建立了综合遗传和临床因素对皮肤反应和吞咽困难的预测模型。受试者工作特征 (ROC) 曲线的曲线下面积 (AUC) 值为 0.657（皮肤反应）和 0.788（吞咽困难）。总之，该研究发现5个SNP（rs6711678、rs4848597、rs4848598、rs2091255 和 rs584547） 是接受放疗的 NPC 患者皮肤毒性和吞咽困难的新风险位点。

Co-author:Xiao F, Zhao Y, Mao CX, Yu LL, Wang LY, Xiao Q, Liu R, Li X, McLeod HL, Hu BW, Huang YL, Lv QL, Xie XX, Huang WH, Zhang W

First Author:Wang Y

Indexed by:Journal paper

Correspondence Author:Guo CX, Li JG, Yin JY

Discipline:Medicine

First-Level Discipline:Pharmaceutical Science

Volume:21

Issue:1

Page Number:169

ISSN No.:1476-4598

Translation or Not:no

Date of Publication:2022-08-23

Included Journals:SCI

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