Associate Professor
Supervisor of Doctorate Candidates
Supervisor of Master's Candidates
Date of Employment:2020-09-09
School/Department:School of Computer Science and Engineering
Education Level:With Certificate of Graduation for Doctorate Study
Business Address:中南大学新校区信息大楼429
Contact Information:zengmin@csu.edu.cn
Degree:Doctoral Degree in Engineering
Alma Mater:中南大学
Discipline:Computer Science and Technology
曾敏，男，中南大学计算机学院副教授，博士研究生导师。于2013年获得兰州大学电子信息科学与技术学士学位；2016年，2020年分别获得中南大学系统科学硕士学位和计算机科学与技术博士学位。主要研究方向是AI for Science，研究工作集中在利用和开发人工智能方法对生物信息学中的交叉前沿科学问题进行探索和研究，具体研究内容包括生物序列分析、疾病相关预测、医学大数据分析等，目前在Nature Communications、Bioinformatics、Briefings in Bioinformatics等国际权威期刊和IJCAI、ECCB等国际顶级会议上发表学术论文60余篇，据Google Scholar统计显示总引用2000余次。担任BMC Bioinformatics的编委，Frontiers in Genetics的客座编辑，CCF-B类推荐会议BIBM、CCF-C类推荐会议APBC、ISBRA的程序委员会成员，担任Nucleic Acids Research、Bioinformatics、Briefings in Bioinformatics等多个国际权威期刊审稿人。主持国家自然科学基金面上项目1项、国家自然科学基金青年项目1项，国家重点研发计划子课题1项，湖南省自然科学基金青年项目1项。参与国家重点研发计划、国家自然科学基金重点项目、国家自然科学基金面上项目等科研项目多项。
硕士招生
每年招收3名左右硕士研究生，招收士兵计划学生，欢迎对人工智能、机器学习、深度学习、生物信息学感兴趣的同学与我联系。课题组会为每一位学生提供良好的科研条件和生活补助。同时也非常欢迎本科期间，具有一定深度学习基础或者良好编程基础，并希望取得科研成果的同学随时联系，一起学习、讨论、共同进步。（邮箱：zengmin@csu.edu.cn）
指导本科生发表论文
[1] Xu Liu, Yiming Li, Fuhao Zhang, Ruiqing Zheng, Fei Guo, Min Li, Min Zeng*. ComLMEss: Combining multiple protein language models enable accurate essential protein prediction. In 2024 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine (BIBM). (CCF-B类推荐会议，刘旭[Xu Liu]同学为2022级计算机科学与技术专业本科生，完成该论文时是大二下学期)
代表性论文（发表论文完整列表，请见我的Google Scholar页面）
# These authors contributed equally to the paper as first authors
* To whom correspondence should be addressed
[1] Min Zeng, Fuhao Zhang, Fang-Xiang Wu, Yaohang Li, Jianxin Wang, Min Li*. Protein–protein interaction site prediction through combining local and global features with deep neural networks. Bioinformatics, 36 (4), 1114-1120, 2020. [PDF] [Code]
[2] Min Zeng, Yifan Wu, Yiming Li, Rui Yin, Chengqian Lu, Junwen Duan, Min Li*. LncLocFormer: a Transformer-based deep learning model for multi-label lncRNA subcellular localization prediction by using localization-specific attention mechanism. Bioinformatics, 39 (12), btad752, 2023. [PDF] [Code]
[3] Min Zeng, Xinyu Zhang, Yiming Li, Chengqian Lu, Rui Yin, Fei Guo, Min Li*. RNALoc-LM: RNA subcellular localization prediction using pre-trained RNA language model. Bioinformatics, 41 (4), btaf127, 2025. [PDF] [Code]
[4] Yalin Hou, Yiming Li, Ruiqing Zheng, Fuhao Zhang, Fei Guo, Min Li, Min Zeng*. Leveraging protein language models for cross-variant CRISPR/Cas9 sgRNA activity prediction. Bioinformatics, btaf385, 2025. [PDF] [Code]
[5] Min Zeng, Yifan Wu, Chengqian Lu, Fuhao Zhang, Fang-Xiang Wu, Min Li*. DeepLncLoc: a deep learning framework for long non-coding RNA subcellular localization prediction based on subsequence embedding. Briefings in Bioinformatics, 23 (1), bbab360, 2022. [PDF] [Code]
[6] Min Li, Baoying Zhao, Rui Yin, Chengqian Lu, Fei Guo, Min Zeng*. GraphLncLoc: long non-coding RNA subcellular localization prediction using graph convolutional networks based on sequence to graph transformation. Briefings in Bioinformatics. 24 (1), bbac565, 2022. [PDF] [Code]
[7] Min Zeng, Jingwei Lu, Yiming Li, Chengqian Lu, Shichao Kan, Fei Guo, Min Li*. CellCircLoc: Deep Neural Network for Predicting and Explaining Cell Line-Specific CircRNA Subcellular Localization. IEEE Journal of Biomedical and Health Informatics, 2025. [PDF][Code]
主持科研项目
[1] 国家自然科学基金面上项目“基于亚细胞定位视角的长非编码RNA与复杂疾病关联预测研究”(62472445)，2025.01~2028.12，主持。
[2] 国家自然科学基金青年项目“面向lncRNA亚细胞定位的序列特征提取方法与预测模型研究” (62102457)，2022.01~2024.12，主持。
[3] 湖南省自然科学基金青年项目“融合生物领域知识的非编码RNA特征表示学习方法在亚细胞定位预测中的应用” (2023JJ40763)，2023.01~2025.12，主持。
[4] 科技部重点研发计划项目子课题“关键模式生物基因组精细研究及其示范应用”(2022YFC3400300)，2022.11~2027.10，子课题负责人。
