陈超
  • 教师名称:陈超
  • 教师拼音:chenchao
  • 电子邮件:
  • 入职时间:2014年02月18日
  • 职称:教授
  • 单位:中南大学
  • 职务:Professor
  • 学历:博士研究生毕业
  • 学位:博士学位
  • 学科:生物学
  • 毕业院校:复旦大学
  • 获得荣誉:中南大学升华猎英计划;
    中南大学第二批创新驱动计划;
    第13届国际人类遗传学大会旅行奖;
    在生物精神病学协会第67届年度科学会议上获报告奖;
    2011年复旦大学优秀博士毕业论文;
  • 办公地点:长沙市开福区湘雅路110号中南大学国家遗传学重点实验室
  • 联系方式:邮箱:chenchaor@gmail.com
  • 所在学院:生命科学学院
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生物信息学常用数据库
发布时间:2016-04-25 点击数:

整理人:李津臣,夏燕


一、表达相关的数据库   

    脑表达数据库:

        HBT:http://hbatlas.org/

        Allen brain atlas:http://www.brain-map.org/

        BrainSpan:http://www.brainspan.org/

        NPdenovohttp://122.228.158.106/NPdenovo/

     其他方面:

        Eurexpress:http://www.eurexpress.org/ee/

        GTEx:http://www.gtexportal.org/home/

        FlyBase http://flybase.org/

二、疾病与表型数据库   

    •所有疾病/表型:

        HGMD:http://www.hgmd.cf.ac.uk/ac/index.php

        ClinVar:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/clinvar/

        OMIM:http://www.omim.org/

        MGI:http://www.informatics.jax.org/

        FlyBase: http://flybase.org/

    •孤独症:

        AutismKB:http://autismkb.cbi.pku.edu.cn/

        SFARI Gene:https://gene.sfari.org/autdb/Welcome.do

        NPdenovo:http://122.228.158.106/NPdenovo/

    •眼科       

        RetinoGenetics:http://122.228.158.106/RetinoGenetics/

三、PPI 数据库  

         Biogrid http://thebiogrid.org/

    PrePPIhttp://bhapp.c2b2.columbia.edu/PrePPI

    STRING: http://string-db.org/

四、突变数据库

    The Exome Aggregation Consortiumhttp://exac.broadinstitute.org/about

    ESP6500 http://evs.gs.washington.edu/

    dbSNP http://www.ncbi.nlm.nih.gov/SNP/

    1000G http://www.1000genomes.org/

五、其他重要数据库    

    NCBIhttp://www.ncbi.nlm.nih.gov/

    GeneCardhttp://www.genecards.org/

    UniProtKBhttp://www.uniprot.org/help/uniprotkb

    UCSChttp://genome.ucsc.edu/

    ENCODEhttp://genome.ucsc.edu/ENCODE/