课题组简介
中南大学李津臣(医学遗传与生物信息)课题组在国家人才计划、国家重点研发计划的支持下围绕基因组医学科学研究与临床应用中的重大科学问题开展系统性的研究,为重大疾病的精准防治提供分子依据。具体研究方向包括:
(1)数据资源赋能精准医学的新方法开发:利用生物信息、深度学习等方法开发精准解读基因组变异致病性和精准鉴定候选基因的新方法、新工具、新平台及数据库,为重大疾病的精准医学研究提供数据资源和工具支撑;
(2)重大疾病新基因鉴定及多组学整合分析:利用基因组为核心的多组学队列数据鉴定孤独症、帕金森病等神经精神类疾病发生发展以及诊疗相关的关键变异和基因,并构建多组学调控网络,为重大疾病的精准诊疗提供分子依据;
(3)生物信息驱动的新基因功能与表型验证:利用分子细胞模型、类脑模型、动物模型方法验证和研究相关基因与变异的分子机制,结合团队生信优势开展相关干湿结合的研究,为认识疾病分子机制提供更多实验证据(详见“医见生信”公众号)。
目前课题组处于快速上升期,课题经费充足,学术氛围自由,项目设计巧妙,众志成城,与国内外一流团队保持密切合作。经过几年的发展,课题组逐步形成了“尊重、诚信、团结、创新”的思想氛围,平均每年发表3-5篇10分以上的研究论文。期待积极主动、具有成长型思维或者具有学科交叉背景的优秀学子加盟,获得个性化的长远规划及赋能,欢迎生物信息和临床医学的本科生保送或报考团队的学术性研究生,均可选择湘雅医院临床医学(学术性)或生命科学学院遗传学专业(研究方向均为医学遗传与生物信息)。本团队的研究生立足于医学科学问题,能够熟练掌握生物信息学、基因组医学、医学遗传学、生物医学大数据相关理论基础、分析方法或实验技能。毕业以后可以进入各大高校、科研院所、三甲医院、科技公司从事遗传学、医学、信息学相关科研、教学与数据分析工作。按照往年经验,大部分毕业的学生都能进入带编制的知名高校和三甲医院的核心团队,能够独挡一面,具有极高的认可度。本团队还长期招聘具有生物信息学、基因组学、医学遗传学、流行病与卫生统计学、计算机科学等专业或背景的助理研究员(带编制)、技术员(带编制)或博士后(优先留院),具体要求可访问课题组主页(http://www.genemed.tech/jclab)或医见生信公众号。
课题组优势
1、注重学生培养
团队特别注重研究生的培养,以兴趣和创新为导向并结合研究生本科专业背景指导学生开展课题,培养学生的模式灵活高效,针对性强,实现团队内老师对学生的一对一指导;
2、数据资源丰富
团队依托多个国家级(国家老年疾病临床医学研究中心、国家精神与心理疾病临床医学研究中心)、省部级平台(湖南省精准分子医学重点实验室、湖南省医学遗传学重点实验室、湖南省神经退行性疾病重点实验室),建立了高标准的临床样本库和基因组数据库,目前拥有神经精神类疾病生物样本及临床资料超50000例,WES/WGS数据超过20000例,多组学数据超过2000例(基因组、转录组、蛋白组、代谢组、微生物组、抗体组等),第三代测序数据超过500例(PacBio HiFi等);
3、分析体系完善
团队建立了多个整合临床表型和遗传信息的数据库及生信分析平台,几乎能够独立完成基因组为核心的所有生信信息分析,为精准挖掘致病基因和分子以及鉴定疾病发病机制奠定了坚实的基础;
4、科研成果丰硕
课题组成员在科研产出方面实力突出,有极强的创新能力;每年产出IF>10分的SCI论文3-5篇(均为课题组学生或博士后为第一作者),课题组多名已毕业的博士及硕士研究生均在国内高校、科研院所、医院等继续深造或工作;
5、全套培训课程
团队召集生信专职人员及专家定期开展一系列生物信息学专题培训,创立“医见生信”公众号、视频号以及B站,发布医学遗传与生物信息的最新研究动态、生信技术、生信培训以及组会论文(http://genemed.tech/lilab),以提高本团队成员的生信基础,推动研究成果产出;
6、团队氛围融洽
课题组坚持“尊重、诚信、团结、创新”的价值观,具有非常融洽的学术氛围,尊重成员研究兴趣和个人特长,为成员制定个性化科研课题及发展规划;
7、成员优势互补
团队凝聚了生物信息学,临床医学、医学遗传学、计算机科学等多学科交叉科研人才,在导师的带领下,团队成员齐心协力,通过有效融合激发出创新的火花,能够从多个角度审视问题并提出全面的解决方案;
8、未来前景可期
优秀硕士毕业可以选择留在课题组或者推荐到其他课题组继续深造,也可以进入各大高校、科研院所、三甲医院、科技公司,从事遗传学、临床医学、生物信息学等学科的科研、教学、医疗及数据分析等相关工作。