主要从事临床微生物革兰阴性细菌耐药机制研究。包括临床微生物检验、医院感染控制、细菌耐药机制及病原微生物致病机理等方面的研究。
一、 耐药菌流行特征及耐药机制研究：
主要研究医院获得性、社区获得性及健康人群耐药菌的流行特征及耐药机制，为医院感染控制及阻止耐药菌向社区传播提供实验室依据。与英国伯明翰大学医学院建 立了长期合作平台。已经在国际上首次发现多个耐药基因注册到基因bank，国际上首次发现中国湖南医院获得性耐药菌流行特征，国际上首次发现中国健康人群 肠道耐药菌ST131-肠杆菌流行特征，该方向发表论文100篇，其中SCI论文10篇，其中IF>5的SCI论文2篇。获得湖南省科技进步奖三等 奖2项。
学术队伍：人员：刘文恩、廖经忠、晏群、刘清霞、李虹玲、李艳冰、钟一鸣、罗珊、陈霞、刘乐平、刘宁、赵娟
二、 艰难梭菌流行特征及致病机制研究：
主要从事艰难梭菌感染检测方法建立、流行特征及致病机制研究。该方向已经发表论文10篇，其中SCI论文4篇（IF>4的SCI论文1篇）,已经与英国伯明翰大学医学院成立“中英感染分子诊断中心”，并一直与英国Peter Hawkey教授有合作研究。
学术队伍：刘文恩、梁湘辉、张运丽、李艳明、胡可、简子娟、彭婉婵、陈伟、杨芳、唐桂华