个人简介
曹东升,中南大学湘雅药学院教授,副院长,博士生导师,中南大学人工智能药学交叉研究中心主任,国家重点研发计划首席科学家、国家自科基金创新研究群体核心成员、国家万人计划青年拔尖人才、湖南省科技创新领军人才、湖南省杰青、湖湘青年英才、中国香江学者人才,湖南省优秀博士论文获得者,国家重点研发计划“生物与信息融合(BT和IT融合)”重点专项2023年度指南编制专家组成员。入选爱思唯尔“中国高被引学者”、“全球前2%顶尖科学家”和“全球顶尖前10万名科学家排名”榜单。研究方向为化学信息学、人工智能药物设计和系统生物学。主要从事基于人工智能技术的高效化学信息学和药物分子设计方法和应用研究,针对药物研发中的三个关键技术瓶颈问题(生物活性分子的发现、成药性和安全性预测及选择性/脱靶效应/耐药性评估),聚焦基于结构/配体的虚拟筛选方法、成药性理论预测、分子靶标识别和分子智能生成和优化展开了系统和深入的多学科交叉方法学研究,实现药物分子“设计-合成-测试-分析”的自动闭环设计系统,并把发展的方法与实验平台无缝衔接用于多个重要靶点的药物分子设计和生物活性分子的作用靶标识别,开发出多类具有全新结构的抗肿瘤先导化合物并揭示了多种生物活性分子的耐药新机制。发展的多种预测模型和程序(如ADMETlab、DDInter、OptADMET、DeepToxLab、ChemFH、ChemoPy、 BioMedR等)已成为化学信息学和AIDD领域的基础工具,被知名药企和国内外同行(Pfizer、Merck、Novartis、哈佛大学、北京大学、上海药物所等)广泛采用,为促进AIDD的学科发展和药物研发的技术进步做出了贡献。累计发表SCI论文260余篇;ESI高被引及扩展ESI高被引论文32篇(热点论文1篇),封面论文3篇。近5年(2019年至今),在Nature Mach Intell、Nat Protoc、Nat Commun、WIREs Comput Mol Sci、Nucleic Acids Res、Research、Acta Pharm Sin B、Chemical Science、Brief Bioinform、J Med Chem、Bioinform、JCTC、 J Cheminformatics、J Chem Inf Model等权威SCI期刊上发表论文120余篇,其中95篇为通讯作者或第一作者(平均影响因子为9.28);单篇最高引用1401次,总引用15700余次(近5年11400余次),H因子为57;开发软件平台39套,获软件著作权28项, 累计访问980万余次;申请中国专利13项,参编英文专著一部。获得中华医学会医学科学技术奖一等奖(排名11)和中国发明协会一等奖(排名3)。指导学生获得第九届中国国际“互联网+”大学生创新创业大赛国家银奖、“挑战杯”中国大学生创业计划竞赛湖南省金奖。主持和承担国家重点研发计划(青年科学家项目和子课题项目)、国家自科基金创新研究群体项目、国家自科基金重点国际合作研究项目、国家重大研究计划青年项目、国家自然科学基金面上项目和青年项目、湖南省重点研发计划、湖南省杰出青年基金、湖南省科药联合基金等国家、省部级和横向科研项目20余项,累计经费2200余万。现任湖南省生物信息学学会副理事长、候任理事长,中国生物信息与药物发现专业委员会常务委员,中国人工智能与生命科学专业委员会委员,中国计算机化学专业委员会委员,中国计算毒理学专业委员会委员。受邀担任SCI期刊CMES-Comp. Model. Eng.副主编和Chemometr. Intell. Lab.编委,Pharmaceuticals 和 Frontier in Pharmarcology等杂志特刊客座编辑。
欢迎热爱人工智能药物设计、有志于人工智能药物开发的青年学子加入团队!
邮箱:oriental-cds@163.com
湘雅药学院新楼418办公室
课题组网站首页:http://team.csu.edu.cn/cbdd/zh_CN/index.htm 和 http://home.scbdd.com/
Google学术:https://scholar.google.com/citations?hl=en&user=kTo-lXEAAAAJ&view_op=list_works
教育经历
[1] 2009.9-2013.5
中南大学 博士 | 博士研究生毕业
[2] 2006.9-2009.5
中南大学 硕士 | 硕士研究生毕业
[3] 2002.9-2006.6
中南大学 学士 | 大学本科毕业
工作经历
[1] 2015.4-2017.3
香港浸会大学
|
中医药学院
|
香江学者
[2] 2014.5-至今
中南大学
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湘雅药学院
|
教授
社会兼职
-
[1] 湖南省生物信息学学会副理事长
-
[2] 中国生物信息与药物发现专业委员会常务委员
-
[3] 中国人工智能与生命科学专业委员会委员
-
[4] 2022.9-至今
中南大学湘雅药学院学科建设办公室主任 -
[5] 中南大学人工智能药学交叉研究中心主任
-
[6] 中南大学临床药学转化与研究中心副主任
-
[7] 湖南省生物医学信息委员会副主任委员
-
[8] 中国计算机化学专业委员会委员
-
[9] 中国毒理学会计算毒理学会委员
-
[10] Chemometr. Intell. Lab.编委
-
[11] CMES-Comp. Model. Eng.副主编
研究方向
其他联系方式
[1] 邮编:
[3] 通讯/办公地址:
[6] 邮箱:
团队成员
团队名称:智能药物创新研究与转化团队成员
邹婵 | |
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吴婷 | |
博士后 |
杜婧颜 | |
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刘坚旺 | |
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郭堃 | |
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何远航 | |
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姜世龙 | |
博士后 |
刘小平 | |
|
钱蓉 | |
博士 |
朱亭霏 | |
博士 |
李辉 | |
博士 |
陈德坤 | |
陈德坤 |
蒋竑立 | |
蒋竑立 |
石少华 | |
石少华 |
魏筱 | |
魏筱 |
刘翀 | |
刘翀 抗菌活性分子的筛选、设计和实验验证研究 |
邱炎龙 | |
邱炎龙 |
龙腾智 | |
龙腾智 利用人工智能和机器学习技术进行分子的毒性预测评估 |
段艳静 | |
段艳静 |
石欢 | |
石欢 |
宁琼如 | |
宁琼如 |
姬凯悦 | |
姬凯悦 靶标预测方法的评价和中药/天然产物分子的靶标筛选 |
朱慧敏 | |
朱慧敏 RSK2抑制剂的筛选、设计和实验验证研究 |
汪蕾 | |
汪蕾 利用主动学习策略来提升各种虚拟筛选方法的筛选性能 |
李卓卓 | |
李卓卓 易反应假阳性化合物/混乱化合物的结构分析和鉴别研究 |
蚁佳才 | |
蚁佳才 基于人工智能技术的分子生成算法开发及网站平台开发 |
张小琛 | |
张小琛 基于人工智能技术的分子性质预测算法研究 |
熊国丽 | |
熊国丽 |
杨梓宜 | |
杨梓宜 |
贺俊宏 | |
贺俊宏 |
赵越 | |
赵越 |
杨芷江 | |
杨芷江 化学信息学软件工具的开发 |
杨素青 | |
杨素青 |
付丽 | |
付丽 |
魏惠 | |
魏惠 |
刘璐 | |
刘璐 |
叶文玲 | |
叶文玲 |
邓振科 | |
邓振科 |
王柠柠 | |
王柠柠 基于机器学习方法的ADMET性质的预测评估 |
黄佳伟 | |
黄佳伟 |
姚志江 | |
姚志江 |
朱民锋 | |
朱民锋 基于机器学习方法的分子性质预测研究及R软件工具开发 |
董界 | |
董界 |